두나무와 네이버파이낸셜의 주식 교환 비율이 1:2.54로 확정되며, 두나무가 최대주주로 올라서는 가운데, 통합법인의 지배구조에 대한 관심이 집중되고 있다. 이번 협약에 따라 두나무의 창업자들이 대주주로서의 지위를 확보하지만, 의결권은 네이버에 위임하는 방식으로 양사가 '윈-윈'을 이루는 구조로 설계되었다.

두나무는 네이버파이낸셜의 100% 자회사가 되며, 기존 두나무의 주주들은 네이버파이낸셜의 신주를 받아 통합 법인의 주주로 전환하게 된다. 초래되는 지분 변동으로 인해 두나무의 기업가치가 15조원으로 네이버파이낸셜의 5조원보다 세 배 높게 평가되면서, 두나무 주주들에게 배정되는 신주 물량도 비례적으로 막대해지게 된다. 이는 두나무 창업자인 송치형 회장과 김형년 부회장이 29.5%의 지분을 보유하게 되며, 기존 최대주주인 네이버(희석 후 17% 지분)보다 주식 소유 권한이 우위에 있는 상황을 초래한다.

이러한 지분 변동은 네이버가 계열사로서의 지위를 상실할 위험을 내포하고 있으나, 이를 보완하기 위해 의결권을 위임하는 전략을 채택하였다. 네이버파이낸셜은 두나무 대표와 주주 간 계약을 통해 경영 권한을 확보하고, 이를 통해 기존과 같은 연결종속법인으로서의 지위를 유지할 계획이다. 이런 방식은 공정거래법 시행령 조항을 활용하여, 30% 미만의 지분율에도 불구하고 네이버가 실질적인 경영 권한을 행사할 수 있게 하는 전략이다.

네이버 측은 이번 통합법인을 통해 스테이블코인 발행 및 블록체인 기술을 활용한 간편결제 시스템 구축에 주력할 예정이다. 두나무의 영업이익이 지난해 1조1863억원에 달하는 만큼, 네이버는 향후 인공지능(AI) 관련 투자를 위한 충분한 자산을 확보할 수 있는 계기가 될 전망이다. 이는 네이버가 글로벌 커머스 생태계와 연계된 새로운 사업 모델을 창출할 수 있는 기회가 될 것이다.

다만, 이 거래의 성공 여부는 금융당국의 규제 완화 및 공정 거래 위원회의 심사에 달려 있다. 특히 금융위원회의 전통 금융사와 가상자산 간의 '금가분리' 정책이 주요한 변수로 작용할 것으로 보인다. 이 거래와 관련된 주식 교환일자는 2026년 6월 30일로 설정되어 있으며, 이는 규제 당국의 심사 과정이 복잡하다는 점을 반영하고 있다.

업계 전문가들은 "형식적으로는 두나무 경영진이 최대주주가 되지만, 실질적인 경영권은 네이버에 계속 귀속될 것"이라며 "네이버는 두나무를 통해 가상자산 분야에 진입하고, 두나무는 네이버의 지원 아래 규제 불확실성을 해소하며 성장할 수 있는 구조"라고 설명하고 있다. 게다가, 플랫폼 사업자인 네이버가 결합하여 생태계를 구성할 경우, 시장에서의 독점 우려도 제기되고 있어 향후 진행 상황을 주의 깊게 살펴봐야 할 시점이다.